Начало системным исследованиям в Воркутинском угольном бассейне было положено еще в 30-е годы XX века. Первыми научными учреждениями стали научно-исследовательская станция Института мерзлотоведения имени Обручева и углехимическая лаборатория, проводившая исследования технологических свойств воркутских углей. Расширение шахтного строительства к концу десятилетия потребовало комплексных научных решений для проектирования рудников и механизации добычи.
В ответ на эти вызовы в декабре 1948 года была организована Центральная научно-исследовательская база (ЦНИБ) бассейна. Уже в 1953 году она получила статус Всесоюзного угольного института (ВУГИ). После ряда административных преобразований, в 1957 году институт, переданный под управление Коми Совнархоза, стал самостоятельным Печорским научно-исследовательским угольным институтом (ПечорНИУИ).
С 1963 года ПечорНИУИ перешла в ведение Госкомитета по топливной промышленности при Госплане СССР, а с 1965 года перешла под крыло Минуглепрома СССР.Постановлением Коми Совнархоза от 7 сентября 1962 года на базе Воркутинской, Интинской, Ухтинской проектно-исследовательских контор Совнархоза создан институт «Печорпроект» с размещением в Воркуте и филиалами в Инте и Ухте.
Завершающим этапом консолидации стало слияние в 1972 году научного ПечорНИУИ и проектного «Печорпроекта» в единую организацию – научно-исследовательский и проектный угольный институт «Печорниипроект».